2021年7月21日/所有的故事

更强的结合:思想和数据的融合

当你将一位经验丰富的数据科学家与一位将人类基因组阅读与临床护理联系起来的领导者配对时,数据融合一点也不乏味。

思想和数据的融合

数据和DNA交汇的地方

那是20世纪90年代初。Phil Hajduk蹲在伊利诺斯州芝加哥北部的一个实验室里,在那里他专注于开发靶向癌细胞的小分子药物。这是一个反复试验的过程,缺乏足够的数据让这位训练有素的化学家去研究和利用新技术。

在威斯康星州,霍华德·雅各布(Howard Jacob)担任威斯康星医学院人类和分子遗传学中心的创始主任。在他大学近20年的任期内,他将成为第一个使用基因组测序或完整DNA蓝图来诊断和治疗病人的团队的一员。

当时他们并不知道,但这两位博士在不同的州从事不同类型的科学研究,几十年后他们相遇了。不仅仅是交叉研究,而是将他们的学科结合在一起,引领生物技术行业最大的数据项目之一。

为收敛而合作

快进到2021年:Hajduk刚刚庆祝了他在艾伯维推动科学进步的28年,但他从长凳上毕业了,现在领导着该公司的IT信息研究团队。在校园对面的一间办公室里,雅各布正在艾伯维(AbbVie)工作四年,负责基因组学研究和数据集成。

他们把他们之间的关系比作他们看待科学数据的方式:看似不相干、毫无关联,但实际上是一个更大的谜团中的不同而又互补的部分。在过去的一年里,这一点变得更加明显,因为Hajduk和Jacob携手应对数字健康革命的下一个部分:数据融合。

简单地说,融合就是把数据放在一起。但为什么这对一家生物制药公司如此重要呢?

雅各布说:“包括我们在内的许多行业面临的挑战是,很难像人类一样提取知识。”“我们受到如何处理大量数据的限制,因此我们正在改变围绕数据利用和生成知识的一切。”

我们以前不是都听过吗?

数据挖掘,机器学习,人工智能。数字医疗革命的前景多年来一直是各行业的头条新闻。现在有什么不同?

现在有足够的数据了。更重要的是,艾伯维领导层的愿景和承诺,要加倍努力,创建更好的数据基础设施,实现知识共享。最终目标:更好地治疗疾病和更广泛地管理卫生保健。

这一承诺引发了该公司负责维护、管理和分析数据的科学组织各部门之间的合作。早期发现的科学。化学。基因组学。健康经济与成果研究团队。患者安全。临床试验等等等等。

每个小组都建立了IT策略、数据库和流程,以支持他们的工作方式。现在,城墙已经倒塌了。在过去的一年里,领导们专注于建立基金会,依靠幕后的数据工程,创建并建立一个具有强大治理的单一内部平台。

Hajduk说,这很重要,但真正的价值在于你把各个部分组合在一起之后的几个步骤,因为仅靠大量的数据无法帮助科学家做出更好的决定。

“我们正在建造的是独特的。这不是一个数据沼泽。这是一个知识平台,”他表示。“我们不仅将数据引入并协调起来,而且我们还会与相关专家坐下来讨论,这些数据意味着什么?我们可以对这些数据进行什么样的解读,我们如何将其推广到整个科学界?”

把它付诸实践

那么,如何向数千名科学家介绍一种新的数据共享心态呢?一次一点,在你前进的过程中学习和提高。

集合团队确定了几个特定的用例,围绕关键问题进行定制,以解决并最终改善患者的治疗。以一个用例为例,“临床试验是不够的”,重点是需要更好地利用真实世界的证据(RWE)。

这个用例倾向于我们如何采用RWE(在临床试验之外收集的)并创建一个特定疾病的更完整的图像。它不仅是组合,而且是对人口统计信息、患者行为、治疗模式和当前护理标准的评估。

雅各布把这比作建立一幅蓝图,或许多大规模的蓝图,在很长一段时间内,创造出一幅关于某种疾病的更完整的图景。

雅各布说:“我们将在数据中找到我们之前没有理解或考虑过的联系。”“我们正在从理论走向可能。”

媒体调查

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